兰州市城关区第二人民医院重点发展的肝胆外科、消化内科、 骨外科、内视镜科、肝病科、 传染科、心、血管、中西医结合肾病治疗中心等科室已形成自己的优势，其中肝胆外科、 消化内镜、骨外科、 肝病被列为兰州市重点学科；肾病中心被命名为“甘肃省中西医结合肾病治疗中心”。 医院开展的30余项科研项目有多项课题获省市科技一、二、三等奖和省医药卫生科技奖。有9名医务人员赴日本研修。 医院下属的肝病研究所，独立研制了“复方虫草珍珠胶囊”、“珠子肝泰胶囊”、“金茵利胆灵”等疗效可靠的系列治疗肝胆疾病的药物，取得了较好的疗效。